乃古石林的植被类型主要是石灰岩常绿阔叶林。多年前，乃古石林的植被遭到破坏，现在所见的植物是多年“自然恢复”的结果。“自然恢复”就是不需要人工协助，只依靠自然演替来恢复已退化的生态系统。自然恢复的植被大多为乡土植被，与环境协调自然。
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